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En mai, les cumuls mensuels de précipitation varient de 100 à 250 mm. Ils représentent 100 à 150 % de la normale sur la Haute-Saône et 150 à 170 % de la normale sur le reste de la région. L’épisode principal se situe en début de période (pluie et neige). La moyenne mensuelle des températures est inférieure à la normale de l’ordre de 1°C. L’insolation mensuelle qui varie du nord au sud de 170 à 200 heures est légèrement déficitaire.

Le déficit pluviométrique se poursuit en mai sur la plupart des postes Météo-France. Les précipitations n'ont bien évidemment pas été suffisantes pour être efficaces et elles n'ont pas permis d'améliorer la situation hydrologique à l'approche de la saison estivale.

Après un arrosage copieux en mai, la tendance à la sécheresse revient rapidement en juin avec des précipitations inférieures à celle observées généralement en cette saison. Les cumuls de pluies sur les six derniers mois sont toujours déficitaires avec des valeurs comprises entre -8% et -39% par rapport aux moyennes interannuelles. Les quelques pluies observées prennent souvent la forme d’orages, parfois violents et accompagnés de grêle, avec leur kyrielle de conséquences dans les zones concernées. Parmi ces épisodes pluvio-orageux, le plus marquant est celui du 6 juin dans le secteur de la Valdaine et de la basse vallée du Guiers où l’on relève des records de débits dans les cours d’eau, les plus forts observés depuis 30 ans, un épisode qui a également touché le Vercors. On pourrait ajouter à celui-ci, les averses de grêle dans la région lyonnaise le 27 juin, ou encore les fortes crues de l’Arve dans la nuit du 27 au 28 juin.

Malgré des précipitations correctes en avril, mai et juin, le déficit annuel est encore net sur une bonne partie de la région (200 à 400 mm). La première décade de juin a bénéficié sur les deux tiers nord de la région de 50 à 100 mm de pluies. Mais les deux dernières décades ont été marquées par des températures record (39°C le 22 juin à Gignac, température moyenne de juin au Mont-Aigoual dépassée de 3.7°C).

La première quinzaine de juin a été marquée par un épisode pluvio rageux durant la période du 4 au 8 juin. Sur la région, les cumuls sont spatialement homogènes (30 et 60 mm en moyenne). Certains domaines sont davantage arrosés, notamment l'est du Var et l'ouest des Alpes-Maritimes qui ont reçu entre 60 et 100 mm, ponctuellement 150 mm au nord de Grasse sur le plateau de Caussols. Sur les zones les plus arrosées, ces précipitations représentent plus de 150 % de la normale pour un mois de juin complet. Il faut cependant relativiser car les normales de juin dans le Var ou les Bouches du Rhône sont voisines de 30 mm. Les excédents sont donc bien maigres et l'évaporation naturelle n' a pas permis une recharge des sols profonds. Ces précipitations ont bénéficié à la végétation et à l'alimentation des retenues naturelles et artificielles.

En juin, les pluies n’ont été constatées qu’en début de mois. Ces pluies, notamment sur le centre Corse, le sud de la Plaine orientale et le versant occidental, ont été, comme pour les deux mois précédents, justes un peu supérieures aux moyennes de référence.